一、江苏大学高性能计算平台简介
江苏大学高性能计算平台于2016年7月正式面向全校公开使用。平台包括以下类型的节点:1、计算节点20个;2、胖节点1个;3、GPU节点/MIC节点各1个。集群采用56Gb InfiniBand网互联。平台拓扑见图1。
图1 高性能计算平台系统拓扑图
二、收费办法
| 校内计算节点用户 | 校内胖节点用户 | 校内GPU/MIC用户 |
申请账号费 | 1000元/个/年 | 1000元/个/年 | |
共享 | 实际使用量 | 每核时0.08元 | 每核时0.16元 | 每块卡2元/小时 |
包年 | 2万(48核) | 9万(96核) | |
包半年 | 1.2万(48核) | 5万(96核) | |
独占 | 包年 | 10万(10个节点) | | |
包半年 | 5万(10个节点) | | |
三、软件列表
并行环境软件 |
序号 | 软件名 | 版本 | 说明及安装路径 |
1 | Ssh脚本 | 1.2.7 | 对于新建立的用户,可以使用ssh脚本建立节点间无密码访问环境,具体操作步骤参见相关文档。 |
安装路径:/opt/SSH |
2 | Intel MPI |
| 安装路径:/opt/intel |
3 | Intel C |
| 安装路径:/opt/intel |
4 | Intel Fortran |
| 安装路径:/opt/intel |
5 | Intel MKL |
| 安装路径:/opt/intel |
6 | BLAS |
| BLAS 库,基本线性代数库(Basic Linear Algebra Subroutines)。 |
安装路径:/opt/intel |
/opt/intel/mkl/libs /blacs |
7 | LAPACK |
| LAPACK,即线性代数计算子程序包(Linear Algebra Package)。 |
安装路径:/opt/intel |
/opt/intel/mkl/apps /scalapack |
8 | FFTW |
| FFTW,即(the Fastest Fourier Transform in the West)库。 |
安装路径:/opt/intel/mkl/include/fftw |
10 | pgi | 10 | /opt/pgi |
11 | openmpi | 1.10.1 | /opt/software/openmpi-1.10.1-gnu |
12 | ansys/fluent/cfx | 14.5 | /opt/software/ansys_inc/v145 |
13 | starccm | 9.06 | /opt/software/CD-adapco/STAR-CCM+9.06.009-R8 |
14 | cmake | 3.4.1 | /opt/software/cmake-3.4.1-Linux-x86_64 |
15 | CPMD | 3.13 | /opt/software/ |
16 | VASP | 5.3.5 | /opt/software/vasp-5.3.5 |
17 | abaqus | 6.13 | /opt/software/simulia/abaqus |
18 | NAMD | 2.1 | /opt/software/NAMD_2.10b1_Source |
16 | gcc | 4.8 | /opt/software/gcc4.8/gcc |
17 | lammps | 2014.2 | /opt/software/lammps |
18 | gromacs | 4.6.7 | /opt/software/gromacs-4.6.7 |
19 | openfoam | 3.0.1 | /home/openfoam/OpenFOAM |
20 | abinit | 8.0.8b | /opt/software/abinit |
21 | quantum-espresso | 6 | /opt/software/qe-6.0 |